위분들 말씀에 좀혼동이 가는데 제가 좀더 설명해드리자면
한국에서 혼인신고시
결혼증명서 원본,번역본
가족카드 복사본,번역본
출생증명서원본,번역본
사진 2~3장
여권원본
배우자 한글로된 도장(풀네임)
수수료 약간
혼인신고서 1장
남편이 직접처리해야함!
결혼증명서,출생증명서는 가급적 복사를 여러장해두세요?
나중에 대사관 결혼비자신청시필요 합니다.
한국에서 혼인신고시 인니대사관을 가시지마시고 관할시구청으로 가셔서  접수하시면 됩니다.
접수후 처리기간은 7~15일 걸리며,
이후 가족관계증명서와 혼인관계증명서 를 발급 받으시어
확인 하시면 됩니다.
혼인신고 접수후 완료되기전 미리 남편분과 배우자분이 추가서류들을 준비하시면됩니다.
한국대사관 접수의경우도 마찬가지입니다.
처리기간은 동일 하며,한국의혼인신고가 완료되야 결혼비자신청이 가능합니다.
대사관접수후 확인방법은 한국내 가족분께 확인요청하시면됩니다.
그리고,서류를 인도네시아로 보내달라고하셔야하는데 위임장이없으면 서류진행이 매우 어렵습니다.

위에 다홍치마님 말씀처럼 한국에서의 혼인신고는 간단합니다...혼인증명서는 원본제출이 맞습니다...인니 혼인신고한 관공서에서 남편꺼하고 아내꺼해서 2통 발급받았습니다
그래서 원본제출했습니다...한가지 더 말씀드리자면 저는 기독교인이라 교회에서도 발급을 받았는데 혼인신고할때 교회에서 받은 증명서를 제출했었습니다. 근데 담당 공무원도 잘 모르고 접수 받았다가 나중에 다시 가서 관공서에서 받은것으로 제출했습니다...ㅎㅎ저도 처음이라 실수가 있었습니다...직접해보시면 별거 아니네라고 할정도로 쉽습니다..

한국에서 혼인신고는 더 간단하고 빨리 끝납니다. 저는 혼인증명서 원본 안내려고 사본 원본대조필 도장 받아갔는데 거기서 무조건 원본이 제출되어야한다고 해서 냈구요. 윗 분 말씀처럼 거기서 혼인 신고서(배치용) 작성하시면되고 혼인증명서 번역 가능하시면 공증 없이 직접 번역해서 적어 내셔도 상관 없어요. 저는 제가 대충 내용들 번역해 적어 냈네요. 그리고 배우자 여권가져가서 혼자 했어요. 제출하고 2-3일 걸렸던 기억이있네요.

인도네시아 한국대사관에서 혼인신고를 하신다해도 바로 비자가나오는건 아닙니다.
절차상 혼인신고후 가족관계증명서와 혼인관계증명서가  필요하구요.
혼인신고를 하셔도 보통15일정도 소요기간이 발생됩니다.
따라서 아예 남편분이 아내분서류를 들고와서 한국에서 직접 하신다음 초청장을 만드셔서 보내주시면됩니다.
배우자 결혼비자 신청방법
1. 양국 혼인신고 완료
2. 초청장,사유서,사전인터뷰 질의서
3. 가족관계 증명서,혼인관계 증명서
4. 부동산 등기부등본  또는 전월세 겨약서 사본
5. 남편 재직증명서최소2년이상이어야 함 또는 사업자등록증사본
6. 신용정보조회서(두분다필요)
7. 범조경력증명서,건강진단서(질병또는 정신이상이있는지여부 기재해야함)
8. 남편 주거래은행 거래내역서
이런식의 서류가 필요할듯합니다.
참 인니에서 발급 받은결혼증명서와 배우자 가족카드,출생증명서와 건강진단서도 필요합니다.

한국에서 혼인신고를 하셔도 제출 서류는 같은 것으로 기억됩니다.
저의 경우에는 그 때당시에 한국에 살고 있었기 때문에 해당 서류를 들고 혼자 구청에 가서
혼인 신고를 했습니다.
그리고, 제출된 Buku nikah 원본은 법원에 보관되기 때문에 반환되지 않습니다.
이미 결혼을 하신 것을 영사관에 고지하면 방문 비자는 받을 수 없고 배우자께서 한국에 거주 중일 경우 결혼 비자로 신청 가능하고, 인니에 KITAS를 보유하고 거주중이라면 멀티 비자 신청이 가능할 것 같습니다.
(제 사견이니 다른 고수님들께서 더 정확한 리플 달아주시길.....)

결혼은 인니에서 하지 않아도 한국에서도 할 수 있는 자유 의사 결정 입니다.
인니 결혼 서류 (buku nikah)공증은 필요 없고 번역 한후  배치된 양식에 기입 하면 되는데..신고서 작성시 신부(예비)의 동행이 필요 합니다..
영사과에 전화로 문의 해보시죠..